Die reinigende Wirkung von Seife beruht auf der Wirkung von Natriumsalzen höherer Fettsäuren. Diese Natriumsalze können in zwei Teile unterteilt werden: Ein Teil ist die polare hydrophile Gruppe -COONa, die wasserlöslich ist, während der andere Teil die unpolare hydrophobe Kohlenwasserstoffgruppe -R ist, die hydrophob und lipophil ist. Beim Waschen von Kleidung löst sich der hydrophobe Kettenteil des Seifenmoleküls in den Ölflecken auf, während sich die hydrophile Carboxylgruppe in das die Ölflecken umgebende Wasser ausdehnt. Die Ölflecken sind von Seifenmolekülen umgeben und bilden stabile Emulsionen. Durch mechanisches Rühren und Spülen mit Wasser werden Ölflecken und andere Verschmutzungen gelöst, in kleinere Emulsionströpfchen verteilt und durch Abwaschen mit Wasser entfernt.
Wenn Seife in Wasser gelöst wird, neigt die hydrophile Carboxylgruppe der Seifenmoleküle auf der Wasseroberfläche dazu, in die Wassermoleküle einzudringen, während die hydrophobe Kohlenwasserstoffkettengruppe abgestoßen und außerhalb des Wassers ausgerichtet wird, wodurch eine gerichtete Anordnung der Seifenmoleküle entsteht. Das Vorhandensein dieser Schicht aus Natriumsalzen höherer Fettsäuren schwächt die Anziehungskräfte zwischen Wassermolekülen auf der Wasseroberfläche, sodass Seife die Oberflächenspannung von Wasser erheblich verringern kann, wodurch es zu einem Tensid wird.
Wenn die Seifenkonzentration im Wasser niedrig ist, liegen Seifenmoleküle in einer Monomerform vor, wobei diese Moleküle an der Wasseroberfläche aggregieren – die hydrophilen Gruppen gelangen ins Wasser und die hydrophoben Gruppen werden von außerhalb des Wassers abgestoßen. Wenn die Seifenkonzentration im Wasser allmählich zunimmt, nimmt die Anzahl der Seifenmoleküle zu, die sich auf der Wasseroberfläche ansammeln und eine monomolekulare Schicht bilden. Wenn die Seifenkonzentration weiter ansteigt, da die Wasseroberfläche bereits besetzt ist, beginnen sich die hydrophoben Kohlenwasserstoffketten innerhalb der Seifenmoleküle in der wässrigen Lösung aufgrund von Van-der-Waals-Kräften zusammenzuschließen, während sich die hydrophilen Carboxylgruppen um die Außenseite wickeln und bilden kolloidale aggregierte Partikel, sogenannte Mizellen.
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